Procesamiento y análisis de Datos Transcriptómicos (RNA-Seq) sin programación

Objetivos

Comprender los conceptos fundamentales de la transcriptómica y sus tecnologías y principales aplicaciones en distintos campos relacionados con la biomedicina, la industria farmacéutica y la industria clínica.

Explorar los conceptos fundamentales del RNA-Seq, qué es y cómo funciona, los distintos tipos que podemos encontrar, así como sus principales ventajas y desventajas respecto a otros métodos ómicos.

Reconocer los errores más frecuentes en el diseño experimental y aplicar estrategias para su optimización.

Conocer los formatos de archivo más comunes que encontraremos a lo largo de un análisis RNA-Seq, así como las principales plataformas utilizadas para obtenerlos.

Describir los principales aspectos a considerar sobre la calidad de los datos y su impacto en el análisis transcriptómico.

• Utilizar la plataforma Galaxy para implementar un análisis completo de RNA-Seq, incluyendo la importación y el preprocesamiento de los datos, así como el análisis, representación visual e interpretación de los resultados.

Comprender los principios de la expresión diferencial y aplicar este análisis a datos de RNA-Seq usando Galaxy.